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驴肠道微生物多样性及代谢功能差异分析的研究

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【作者】 刘桂芹格日乐其木格邢敬亚苏少锋张心壮曲洪磊赵一萍芒来

【Author】 Liu Guiqin;Gerelchimeg Bou;Xing Jingya;Su Shaofeng;Zhang Xinzhuang;Qu Honglei;Zhao Yiping;Mang Lai;

【通讯作者】 芒来;

【机构】 内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区马属动物遗传育种与繁殖重点实验室农业农村部马属动物遗传育种与繁殖科学观测实验站内蒙古农业大学马属动物研究中心聊城大学农学院山东省黑毛驴高效繁育与生态饲养工程技术研究中心山东省驴产业科技协同创新中心国家胶类中药工程技术研究中心东阿阿胶股份有限公司

【摘要】 驴的后肠是一个复杂的发酵罐,肠道微生物对驴的健康和能量供应起着至关重要的作用。试验通过对2岁左右德州公驴屠宰后采集消化道内容物,利用16S rRNA基因V3-V4高变区进行高通量测序,对消化道微生物区系进行表征和代谢功能预测。结果表明:①本试验共得到3 106 234条有效序列,进行物种注释后共获到7 459个OTU,属于35个门、55个纲、118个目、222个科、512个属。前后肠共2 960个核心OTU,前肠独有996个,后肠独有2 059个;②细菌物种的丰富度指数、多样性指数、系统发育多样性指数等在驴前肠和后肠之间存在极显著差异(P<0.01);③在菌门水平上,前肠优势菌门顺序为厚壁菌门(92.4%)、变形菌门(3.5%)、拟杆菌门(2.7%)和放线菌门(0.8%);后肠厚壁菌门(55.7%)、拟杆菌门(34.2%)、螺旋体门(3.7%)和变形菌门(3.1%);④在属水平上,优势菌属顺序前肠为乳酸杆菌属(50.1%)、链球菌属(21.2%)、未分类的梭菌属(10.4%)、放线杆菌属(2.0%),后肠为乳杆菌属(5.7%)、链球菌属约(4.4%)、未分类的旋体属(2.2%)、未分类的梭菌属(1.1%);⑤FAPROTAX功能预测发现,前肠内容物微生物功能较为简单,氮代谢、动物寄生虫和共生体清除功能、发酵作用、化能异养等主要集中在前肠,后肠主要为厌氧和好氧作用、氮呼吸、人类传染疾病等功能。这一结果与驴的前、后肠功能差异和特点吻合,所获得数据为进一步了解驴的消化吸收机制,制定更适宜的饲养方案奠定了基础。

【关键词】 前肠后肠微生物α-多样性
【基金】 国家自然基金[31860636];东省现代农业产业技术体系驴产业创新团队项目资助[SDAIT-27]
【所属期刊栏目】 试验研究 (2019年19期)
  • 【DOI】10.13302/j.cnki.fi.2019.19.006
  • 【分类号】S822
  • 【下载频次】60
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