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苹果中Ty1-copia型逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

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【作者】 孙俊房经贵高兵章镇孙其宝

【Author】 SUN Jun, FANG Jing-gui,GAO Bing, ZHANG Zhen, SUN Qi-bao (Department of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing,Jiangsu 210095 China;Department of Horticulture , Anhui Agricultural University, Hefei, Anhui 230036 China; Horticultural Research Institute, Anhui Academy of Agriculture Science , Hefei, Anhui 230031 China)

【机构】 南京农业大学园艺学院安徽省农业科学院园艺研究所 南京 210095 安徽农业大学园艺系合肥 230036南京 210095合肥 230031

【摘要】 利用苹果叶片为材料,通过PCR扩增、克隆研究了苹果中Ty1-copia型逆转座子的逆转录酶序列。结果表明:(1)逆转座子在1个砧木及7个品种中都能检测到,说明逆转座子在苹果砧木及不同种质中普遍存在。(2)克隆、分析了嘎拉品种中23条逆转座子的逆转录酶序列,分析表明同一基因组中克隆到的逆转录酶序列存在高度的异质性,具体表现为23条逆转录酶序列核苷酸序列长度变化范围是247-279bp,其长度相差32bp,主要表现为缺失突变;其中6条序列中存在1-4个程度不同的终止密码子突变;氨基酸序列同源性的变化范围为21%-98.9%。(3)将23条序列与已发表的不同物种同一类型逆转座子的逆转录酶序列进行聚类分析,表明苹果的Ty1-copia型逆转座子与甜菜、水稻、马铃薯、燕麦及挪威云杉等物种的同类型逆转座子可能有相同的起源。

【关键词】 逆转座子逆转录酶苹果异质性进化
【基金】 国家自然科学基金资助项目(30200190)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2005.03.001
  • 【分类号】S661.1
  • 【被引频次】31
  • 【下载频次】344
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