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组织培养条件下苹果Ty1-copia类逆转座子的转录活性(英文)

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【作者】 孙俊房经贵陶建敏蔡斌华章镇

【Author】 SUN Jun1,2, FANG Jing-gui1, TAO Jian-min1, CAI Bin-hua1, ZHANG Zhen1 (1Horticultural Department,Nanjing Agricultural University,Nanjing,Jiangsu 210095 China; 2Horticultural Department,Anhui Agricultural University,Hefei,Anhui 230036 China)

【机构】 南京农业大学园艺学院南京农业大学园艺学院 南京210095安徽农业大学园艺系合肥230036南京210095南京210095

【摘要】 研究了苹果基因组中Ty1-copia类逆转座子的转录活性、多样性及其甲基化水平。在培养基MS+2,4-D2mg/L+BA0.2mg/L+NAA0.5mg/L上诱导了1个月的愈伤组织中用RT-PCR方法检测到了270bp的目的条带,而对照、继代组培苗和不含2,4-D的愈伤中均没有目的条带的扩增,说明一定浓度的2,4-D可以诱导苹果中Ty1-copia类逆转座子的表达活性。将目的条带回收、克隆和测序后进行分析:所克隆的21条序列虽都为Ty1-copia类逆转座子逆转录酶保守序列,但存在很大的异质性,21个克隆的核甘酸序列变化范围为196-290bp;翻译成氨基酸后存在缺失、插入、移框和终止密码子突变,7个克隆在氨基酸保守序列‘SLYGLKQ’处有1-2氨基酸位点的突变,说明这些序列对应的逆转录酶多数可能已失去了其原有功能。将21条序列进行聚类分析,除ART20外,其它克隆可聚为3类,并分别与GenBank上某些物种的相应序列同源性很高,表明在不同物种间可能存在逆转座子的横向传递作用。甲基化试验表明苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子甲基化水平高。这些都表明Ty1-copia类逆转座子对苹果基因型的多样性及基因组的进化具有重要意义。

【基金】 国家自然科学基金资助项目(30200190)
  • 【分类号】S661.1
  • 【被引频次】10
  • 【下载频次】227
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