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番木瓜丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类抗病基因同源序列的克隆与特征分析

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【作者】 杜中军王家保黄俊生翟衡徐兵强

【Author】 DU Zhong-jun1,2,WANG Jia-bao1 ,HUANG Jun-sheng1*, ZHAI Heng2, XU Bing-qiang1 (1State Key Laboratory for Tropical Crop Biotechnology, Institute of Tropical Bioscience, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Haikou,Hainan 571101 China; 2Horticultural College, Shandong Agricultural University, Tai’an, Shandong 271018 China)

【机构】 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所热带生物技术国家重点实验室山东农业大学园艺学院中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所热带生物技术国家重点实验室 海口571001山东农业大学园艺学院山东泰安271018海口571001山东泰安271018

【摘要】 根据丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类抗病基因产物催化结构域Ⅰ和Ⅸ的氨基酸保守序列设计简并引物,PCR扩增番木瓜叶片基因组DNA和cDNA。在NCBI中用BlastX比对发现,5个来自基因组DNA的克隆和4个来自叶片cDNA的克隆可能编码的氨基酸残基序列属于STK蛋白激酶类抗病基因同源序列片段和受体样蛋白激酶基因的同源片段,命名为gPK1-gPK5和cPK1-cPK4,在GenBank注册得到序列号分别为AY693385-AY693389,AY738762-AY738765。除克隆gPK5含有内含子之外,其它都发现了连续阅读框ORF。通过分析除Gpk5之外的8个克隆可能编码氨基酸序列中丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类蛋白激酶的9个催化保守结构域Ⅰ-Ⅸ,并利用ClustalW软件对8个克隆和已报道的抗病蛋白水稻Xa21和西红柿Pto氨基酸残基序列进行分子系统进化树分析发现,8个克隆不仅是受体样蛋白激酶基因的同源片段而且是抗病候选基因片段。

【基金】 中国博士后科学基金(2005037628)。
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2006.01.011
  • 【分类号】S667.9
  • 【被引频次】13
  • 【下载频次】549
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