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番茄环斑病毒悬钩子分离物复制酶基因的克隆及序列分析

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【作者】 白静陈红运傅俊范朱水芳

【Author】 BAI Jing1,2, CHEN Hong-yun2, FU Jun-fan1, ZHU Shui-fang2*(1Department of Plant Protection, Shenyang Agricultural University, Shenyang, Liaoning 110161 China; 2Institute of Animal and Plant Quarantine, Chinese Academy of Inspection and Quarantine, Beijing 100029 China)

【机构】 沈阳农业大学植物保护学院中国检验检疫科学研究院动植物检疫研究所中国检验检疫科学研究院动植物检疫研究所 沈阳110161 中国检验检疫科学研究院动植物检疫研究所北京100029沈阳110161

【摘要】 番茄环斑病毒(ToRSV)是一种高风险的检疫性有害生物,可侵染桃、李、葡萄、苹果、樱桃等多种植物。2000—2001年,我国从法国进口的葡萄插条上检出过此病毒。以ToRSV悬钩子分离物(Rasp-2)总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增病毒复制酶基因(RdRp)的cDNA片断并将其克隆到pMD18-T载体上。序列测定结果表明,Rasp-2RdRp基因由2133个核苷酸组成,编码711个氨基酸;Rasp-2半胱氨酸蛋白酶和RdRp之间的蛋白酶切割位点为Q/V。Rasp-2与其他分离物及株系RdRp基因的核苷酸序列同源性为79%~84%,氨基酸序列同源性为89%~94%。聚类分析结果显示,葡萄黄脉株系(GYV)与其他分离物及株系关系最远,Rasp-2与其他分离物及株系亲缘关系较近。证实Rasp-2与另外2个悬钩子分离物Rasp和Rasp-1的核苷酸序列存在明显变异。

  • 【分类号】S432.41
  • 【被引频次】1
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