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扁桃PGIP基因的克隆及其序列分析

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【作者】 武彦霞田建保曹秋芬樊新萍杨晓宇

【Author】 WU Yan-xia1,3, TIAN Jian-bao1, CAO Qiu-fen2, FAN Xin-ping1, YANG Xiao-yu1 (1Institute of Pomology , Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Taigu, Shanxi 030815 China; 2Biotechnolgy Research Center,Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Taiyuan, Shanxi 030015 China; 3College of Horticulture, Shanxi Agricultural University,Taigu,Shanxi 030801 China)

【机构】 山西省农业科学院果树研究所山西省农业科学院生物技术中心山西省农业科学院果树研究所 山西太谷030815山西农业大学园艺学院山西太谷030801山西太谷030815山西太原030015

【摘要】 以晋扁一号扁桃(Prunus dulcis Miller.)基因组DNA为模板,用已登录的扁桃PGIP(多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白)基因保守序列设计引物进行PCR扩增,得到了6个PGIP基因片段并克隆到PBS-T载体中。根据测序结果分析,可利用其中的3个片断,分别命名为PdPGIP1(717bp),PdPGIP2(864bp)和PdPGIP3(796bp),与公共数据库中的序列相似性比较,其中PdPGIP2和PdPGIP3各包含2个外显子和1个内含子,内含子符合GT-AG规律。其核苷酸序列分别与Genbank中登录的3个扁桃以及桃(P.persica Linn.)、杏(P.armeniaca Linn.)、美洲李(P.americana Marsh.)、中国李(P.salicina Lindl.)、马哈利樱桃(P.mahaleb Linnaeus)、苦樱桃(P.emarginata Walp.)、梅(P.mume Sieb.)的mRNA、DNA序列显示出极高的同源性,基本都在90%以上,其中PdPGIP1、PdPGIP2、PdPGIP3与Genbank中登录的3个扁桃PGIP基因的同源性为92%~99%。对氨基酸序列保守性分析发现,含有多数植物PGIP抗病基因表达蛋白特有的亮氨酸重复序列。证明我们所克隆的目的片段为PGIP基因。

【关键词】 扁桃PGIPDNA克隆测序
【所属期刊栏目】 研究论文 (2008年01期)
  • 【分类号】S662.9
  • 【被引频次】19
  • 【下载频次】315
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