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砂梨扩展蛋白基因cDNA克隆及全序列分析

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【作者】 宋长年乔玉山章镇胡钟东渠慎春熊爱生姚泉洪

【Author】 SONG Chang-nian1,QIAO Yu-shan1,ZHANG Zhen1,HU Zhong-dong1,QU Shen-chun1,XIONG Ai-sheng2,YAO Quan-hong2(1Laboratory of Biotechnology forFruit Trees,College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095 China;2Biotechnology Research Institute,Shanghai Academy of Agricultural Science,Shanghai 201106 China)

【机构】 南京农业大学园艺学院果树生物技术研究室上海市农业科学院生物技术研究所上海市农业科学院生物技术研究所 南京210095南京210095上海201106

【摘要】 设计植物EXP扩展蛋白简并引物,以砂梨果实cDNA为模板,克隆得到EXP基因cDNA片段,该片段长465 bp。根据该片段序列,分别设计2条5’和3’末端扩增的特异引物,利用RACE技术,获得了该片段的5’端和3’端序列。用DNAMAN5.22软件对3个序列进行拼接和分析,获得了该基因的cDNA全长,命名为Pyp-EXP。该cDNA全长为1 395 bp,5’端起始密码子ATG始于72 bp,3’端终止子TAG止于830 bp,Ploy+(A)从1 363~1 395 bp。该基因已在GenBank基因数据库注册,注册号为EF602031。Pyp-EXP核苷酸序列有一个759 bp完整的开放阅读框,编码区与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃的同源性分别为96%,96%,94%和86%;该cDNA推导编码252个氨基酸,含有1个组氨酸(His_Phe_Asp,HFD)功能域,与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃中相应序列同源性分别为98%,97%,95%和93%。该基因的克隆为研究扩展蛋白的时空表达及其在果实发育和成熟过程中的作用奠定了基础。

【关键词】 砂梨扩展蛋白分子克隆序列分析
【基金】 江苏省高技术研究项目(BG2006313);国家高技术研究与发展计划重点项目(2006AA100108)
【所属期刊栏目】 研究论文 (2008年02期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2008.02.003
  • 【分类号】S661.2
  • 【被引频次】5
  • 【下载频次】363
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