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中国樱桃泰山干樱S-RNase基因的克隆及序列分析

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【作者】 吴俊李晓张绍铃刘庆忠

【Author】 WU Jun1, LI Xiao1, ZHANG Shao-ling1*,LIU Qing-zhong2 (1College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing,Jiangsu 210095 China; 2Shandong Fruit Research Institute,Taian,Shandong 271000 China)

【机构】 南京农业大学园艺学院山东省果树研究所 南京210095南京210095山东泰安271000

【摘要】 以中国樱桃品种泰山干樱为试材,利用李属植物C2、C5保守区引物,扩增花柱S-RNase基因,获得4个S等位基因,测序结果表明序列大小分别为:1608、950、796、504bp。根据同源比较发现大小为796bp的等位基因与基因库中登录的S1-RNase为同一基因,其它3个S-RNase基因为首次报道,依序列大小分别命名为S2(1608bp,登陆号EF541168)、S4(950bp,登陆号EF541173)和S6(504bp,登陆号EF541172)。序列分析表明S2-RNase在C3区存在终止密码子,导致翻译提早终止;S4-RNase的C5区前有插入片断;S6-RNase在高变区比其它S等位基因少一个氨基酸残基。氨基酸序列同源性比较分析表明,中国樱桃S-RNase与樱花、扁桃的相似性高。在系统进化树中中国樱桃的4个S-RNase基因的氨基酸序列和樱花、扁桃、甜樱桃、酸樱桃等一起归于李亚科。

【关键词】 中国樱桃自交亲和S-RNase序列系统树
【基金】 国家自然科学基金(30671437);中国博士后科学基金资助项目2005037740;江苏省博士后科学基金
【所属期刊栏目】 研究论文 (2008年03期)
  • 【分类号】S662.5
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】223
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