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槜李等15个李品种S基因型鉴定及其多态性分析

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【作者】 张树军黄绍西张绍铃吴俊衡伟吴华清宋宏峰

【Author】 ZHANG Shu-jun1, HUANG Shao-xi1, ZHANG Shao-ling1*, WU Jun1, HENG Wei1, WU Hua-qing1, SONG Hong-feng2 (1College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu 210095 China; 2Research Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing, Jiangsu 210014 China)

【机构】 南京农业大学园艺学院江苏省农业科学院园艺研究所 南京210095南京210095南京210014

【摘要】 利用李属S-RNase基因特异性引物,对15个供试李品种进行PCR扩增,共获得30个目的条带。对这些目的条带进行测序鉴定出15个李品种的S基因型。通过与NCBI中利用BLASTn与GenBank+EMBL+DDBJ+PDB等数据库中的序列比对,结果表明,其中9个为新S-RNases基因,对9个新S-RNases核苷酸序列进行分析发现,位于高变区内的内含子大小为141~1758bp,其同源性为33.9%(S-18~S-19)~81.6%(S-20~S-21),表现出丰富的长度和序列多态性;编码区的核苷酸序列比对结果,其同源性为73.3%(S-16~S-19)~91.7%(S-17~S-22);其推导氨基酸序列相似性为67.3%(S-16~S-19)~89.1%(S-17~S-22);包含李属S-RNase一级结构所共有的C2、C3保守区和高变区(RHV)。系统进化分析表明,9个新S-RNases与李属其它树种S-RNases聚类在一起,归属为李亚科(Prunoideae)。

【关键词】 自交不亲和性S-RNase基因
【基金】 国家自然科学基金(30671437)
【所属期刊栏目】 研究论文 (2008年03期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2008.03.011
  • 【分类号】S662.3
  • 【被引频次】20
  • 【下载频次】253
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