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扁桃SFB基因的克隆及其生物信息学分析

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【作者】 郭长奎罗淑萍何天明李疆高启明

【Author】 GUO Chang-kui1,LUO Shu-ping1,HE Tian-ming2,LI Jiang2,GAO Qi-ming2(1College of Agronomy,Xinjiang Agricultural University,Urumqi,Xinjiang 830052 China;2College of Forestry and Horticulture,Research Centre of characteristic Fruit,Xinjiang Agricultural University,Urumqi,Xinjiang 830052 China)

【机构】 新疆农业大学农学院新疆农业大学林学与园艺学院,新疆农业大学特色果树研究中心

【摘要】 以新疆扁桃栽培品种麻壳的花药为材料,利用RT-PCR和RACE技术,克隆到了一个全长为1131bp的SFB基因(Genbank登录号为:EU909685),命名为AcSFB10。该基因编码376个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序。经生物信息学分析,推测AcSFB10蛋白的分子式为C2000H3033N517O558S23,相对分子质量为43985.5,等电点为6.02,二级结构以α螺旋为主;理论推导半衰期大约为30h,不稳定参数为53.21,属于不稳定蛋白;并且推测此蛋白为亲水性、非分泌型蛋白,在基质内起裂合酶的作用,特异性的识别底物,正好吻合了F-box蛋白的作用。

【关键词】 扁桃自交不亲和SFB基因生物信息学
【基金】 国家自然科学基金(30760146);国家科技支撑项目(2007BAD36B01)
【所属期刊栏目】 研究论文 (2009年02期)
  • 【分类号】S662.9
  • 【被引频次】18
  • 【下载频次】452
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