节点文献

基于EST的猕猴桃SSR标记的建立

免费订阅

【作者】 姜春芽徐小彪廖娇辜青青刘善军陈金印

【Author】 JIANG Chun-ya, XU Xiao-biao*, LIAO Jiao, GU Qing-qing, LIU Shan-jun, CHEN Jin-yin (College of Agronomy, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, Jiangxi 330045 China)

【机构】 江西农业大学农学院

【摘要】 利用NCBI公共数据库最新公布的猕猴桃EST(Expressed Sequence Tag)序列,开发猕猴桃的SSR(Simple Se-quence Repeats)标记。对来源于猕猴桃(Actinidia spp.)非冗余EST数据库(NCBI dbEST)的56400条基因序列使用SSRHunter1.3软件进行了SSR筛查,从中共获得了7939条SSR。应用Primer5.0软件设计合成了85对猕猴桃EST-SSR引物,从中筛选出可进行荧光标记的6对引物:Ad01、Ad02、Ad03、Ad09、Ad42、Ad72。利用该6对EST-SSR荧光标记引物在DNA测序仪上对猕猴桃种质的多态性进行了PCR检测,结果表明均能清晰地产生多态性分离。研究结果表明,通过猕猴桃EST数据库的发掘能够有效地筛选到基因水平的SSR标记。

【关键词】 猕猴桃EST序列SSR标记
【基金】 国家自然科学基金(No.30660113;30860167)
【所属期刊栏目】 研究报告 (2010年04期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2010.04.026
  • 【分类号】S663.4
  • 【被引频次】12
  • 【下载频次】350
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

浏览历史:
下载历史: