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平邑甜茶MhWRKY15基因cDNA克隆及其生物信息学分析

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【作者】 孙晓莉冉昆杨洪强李强姜倩倩

【Author】 SUN Xiao-li,RAN Kun,YANG Hong-qiang,LI Qiang,JIANG Qian-qian (College of Horticulture Science and Engineering,Shandong Agricultural University· State Key Laboratory of Crop Biology;3Shandong Provincial Key Laboratory of Fruit Biology,Tai’an,Shandong 271018 China)

【机构】 山东农业大学园艺科学与工程学院·作物生物学国家重点实验室·山东省果树生物学重点实验室

【摘要】 以平邑甜茶为材料,通过RT-PCR和RACE技术,获得平邑甜茶WRKY15基因的全长cDNA,命名为Mh-WRKY15(GenBank登陆号:GU576874)。生物信息学分析表明,该基因全长1 091 bp,包含810 bp的完整开放读码框,编码269个氨基酸,属于WRKY类转录因子的第II组,为WRKY15家族成员;其编码蛋白为可溶性蛋白,分子式为C1263H1941N365O425S12,相对分子量为29 423.2 ku,理论等电点为5.30;含有一个WRKY保守结构域,定位于细胞核,存在磷酸化、N糖基化和O糖基化位点,其二级结构主要以无规则卷曲为主。

【关键词】 平邑甜茶WRKY15cDNA生物信息学
【基金】 国家转基因生物新品种培育重大专项(2008ZX08009-3);高校博士点专项科研基金(20103702110003)
【所属期刊栏目】 研究论文 (2011年06期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2011.06.013
  • 【分类号】S661.1
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】166
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