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杧果MGAPDH同源基因的克隆及其表达分析

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【作者】 罗聪何新华胡颖谭超欧世金

【Author】 LUO Cong1,HE Xin-hua1,2,HU Ying1,TAN Chao1,OU Shi-jin1 (1College of Agriculture,Guangxi University,Nanning,530004;2Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Lab,Nanning,530007 China)

【机构】 广西大学农学院广西作物遗传改良与生物技术重点实验室

【摘要】 甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是糖代谢和能量代谢过程中的关键酶。根据GAPDH基因保守序列设计PCR引物,利用RT-PCR和改良RACE技术,首次从杧果中分离克隆出MGAPDH同源基因的cDNA全长序列。该序列全长为1 356 bp,开放阅读框为1 203 bp,编码401个氨基酸。利用分子生物学软件对MGAPDH蛋白进行生物信息学分析,结果显示:MGAPDH蛋白分子量为42.8 ku,等电点为8.9;该蛋白包含2个功能域,即NADB_Rossmannsuperfamily和Gp_dh_C superfamily;MGAPDH蛋白不含信号肽序列和跨膜结构,是非分泌蛋白,位于叶绿体中。氨基酸序列进化分析结果显示,杧果MGAPDH蛋白可能与光合作用有关。半定量分析显示,杧果MGAPDH同源基因在杧果不同组织中均表达,并且表达水平差异不明显,说明杧果MGAPDH同源基因可作为杧果基因差异表达的内参基因。

【基金】 广西高等学校优秀人才资助计划项目(桂教人201065);广西自然科学基金(2011GXNSFA018115);广西教育厅研究生创新计划项目(105931001011)
【所属期刊栏目】 研究论文 (2011年06期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2011.06.025
  • 【分类号】S667.7
  • 【被引频次】15
  • 【下载频次】167
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