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草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析

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【作者】 刘建成段可李静叶正文苏建宇高清华

【Author】 LIU Jian-cheng1,2,3,DUAN Ke2,LI Jing3,YE Zheng-wen3,SU Jian-yu1,GAO Qing-hua3(1College of Life Sciences,Ningxia University,Yinchuan,Ningxia 750021 China;2Institute of Biotechnology,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 201106 China;3Forestry and Fruit Research Institute of Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai Key Laboratory of Protected Horticultural Technology,Shanghai 201403 China)

【机构】 宁夏大学生命科学学院上海市农业科学院生物技术研究所上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室

【摘要】 利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2 434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1 893 bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表达,但在茎尖分生组织中表达水平最高,且在叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响。

【关键词】 草莓NBS-LRR基因同源克隆基因结构进化树RT-PCR
【基金】 上海农科院科技发展基金项目(农科发2008(02));上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2008)第1-4号);上海市科委自然科学基金项目(10ZR1426700),上海市科委青年科技启明星计划(09QA1405300)
【所属期刊栏目】 研究论文 (2011年06期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2011.06.026
  • 【分类号】S668.4
  • 【被引频次】14
  • 【下载频次】399
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