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苹果栽培品种SSR指纹图谱的构建

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【作者】 王立新张小军史星雲高华赵政阳

【Author】 WANG Li-xin1,ZHANG Xiao-jun1,SHI Xing-yun1,GAO Hua1,2*,ZHAO Zheng-yang1,2*(1College of Horticulture,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100 China;2Apple E&T Research Centre of Shaanxi Province,Yangling,Shaanxi 712100 China)

【机构】 西北农林科技大学园艺学院陕西省苹果工程技术研究中心

【摘要】 【目的】通过构建苹果栽培品种的SSR标记指纹图谱数据库,以实现对苹果品种的快速、准确鉴定。【方法】以国内外40个主要栽培品种为试验材料,选用均匀分布于17条染色体上的144对SSR引物进行PCR扩增并采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳与SSR荧光标记毛细管电泳相结合的方法进行检测。【结果】结果表明,从144对SSR引物中筛选出了35对多态性较高、谱带清晰的引物,35对引物共检测到314个等位基因,每对SSR引物扩增出等位基因数3~15个,平均8.97个;多态性信息含量指数(PIC)变化为0.455 3~0.834 6,平均为0.692 0;各个位点的杂合度在0.475 0~1.000 0,平均为0.794 3;标记系数(MI)平均为6.208 0,其中CH04c10引物对苹果基因组DNA变异检测最有效,其多态性信息含量指数和标记指数均最高,分别为0.834 6和12.519 0。以CH03d07、NZ02b1和CH05c04这3对引物进行组合鉴定,即可将40个苹果品种完全区分开。与6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测能更准确读出目标片段的大小,检测效果更为理想,更适合于DNA指纹图谱数据库的建立。【结论】将2种检测方法结合构建苹果品种DNA指纹图谱,结果更准确、更可靠。

【关键词】 苹果SSR标记荧光标记指纹图谱
【基金】 公益性行业(农业)科研专项(200903008-11);陕西省科技统筹创新工程计划项目(2011KTZB02-02-01);国家现代苹果产业技术体系(CARS-28)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2012年06期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2012.06.009
  • 【分类号】S661.1
  • 【被引频次】45
  • 【下载频次】693
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