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利用DGE对黄肉猕猴桃果实着色过程中相关差异基因表达的解析

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【作者】 高洁黄春辉葛翠莲曲雪艳辜青青徐小彪

【Author】 GAO Jei,HUANG Chun-hui,GE Cui-lian,QU Xue-yan,GU Qing-qing,XU Xiao-biao(College of Agronomy,Jiangxi Agricultural University,Nanchang,Jiangxi 330045 China)

【机构】 江西农业大学农学院

【摘要】 【目的】构建数字基因表达谱(DGE),寻找调控黄肉猕猴桃果实呈色的潜在关键基因。【方法】以中华猕猴桃(Actinidia chinensis Planch)黄肉品种‘金丰’为试材,利用Illimina/Hisseq测序技术构建其果实发育中3个不同转色期DGE文库,以转录组数据为参考数据库,进行GO功能富集以及Pathway功能富集分析。【结果】结果表明,DGE文库构建转色前期、转色期和成熟期分别获得4 724 009,4 565 159和4 626 730个标签。转色期与转色前期之间差异表达基因的个数为2 641个,成熟期与转色前期有差异表达的基因个数是2 671,成熟期与转色期之间有1457个基因有表达差异。通过GO功能富集及Pathway功能富集分析,分别获得了102条叶绿素Unigenes与111条类胡萝卜素Unigenes,其中12条叶绿素Unigenes及14条类胡萝卜素Unigenes在果实的3个不同转色期有显著差异表达(P<0.05)。【结论】黄肉猕猴桃呈色的关键基因可能存在于具有显著差异表达的12条调控叶绿素合成以及14条调控类胡萝卜素合成的Unigenes之中。

【基金】 国家自然科学基金(31160385);江西省科技支撑计划(20121BBF60022)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2013年03期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2013.03.009
  • 【分类号】S663.4
  • 【被引频次】16
  • 【下载频次】623
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