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香蕉幼果SSH文库构建及初步分析

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【作者】 颜园园王静毅冯素萍陈友武耀廷

【Author】 YAN Yuan-yuan1,2,WANG Jing-yi2,FENG Su-ping3,CHEN You3,WU Yao-ting3(1Agricultural College,Hainan University,Haikou,Hainan 570228 China;2Ministry of Agricultural Key Laboratory of Tropical Crop Biotechnology,Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences(CATAS),Haikou,Hainan 571101 China;3Qiongzhou University,Sanya,Hainan 572022 China)

【机构】 海南大学农学院中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室琼州学院

【摘要】 【目的】构建香蕉果实发育抑制差减文库,筛选果实发育相关基因。【方法】以皇帝蕉幼果为实验组,幼叶为对照组,构建差减文库,并用Blast2GO软件进行生物信息学分析。【结果】挑选982个重组子菌液PCR筛选cDNA文库,得到750个候选克隆。对其中200个克隆进行测序、去载体序列、拼接后,获得92个unigenes。在GenBank中进行同源性比较,共有81个找到同源序列,11个cDNA未找到同源序列。75个unigenes在GO数据库中有功能注释,涉及到的细胞组分、分子功能和生物过程分别为53个、72个和60个,显示果实发育差异主要与在细胞内部组分进行的代谢过程的强度,以及其他一些因子和激酶的影响有关。【结论】成功构建皇帝蕉果实的差减cDNA文库,为进一步开展香蕉果实发育相关基因如tubulin、P450等基因的克隆及功能鉴定奠定了重要基础。

【关键词】 皇帝蕉果实发育抑制差减杂交cDNA文库
【基金】 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(ITBB110215)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2013年03期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2013.03.011
  • 【分类号】S668.1
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】112
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