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苹果EST-SSR引物的开发及部分品种亲缘关系分析

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【作者】 宋尚伟张恒涛张芳明王娟陶永焕

【Author】 SONG Shang-wei1,ZHANG Heng-tao2,ZHANG Fang-ming1,WANG Juan1,TAO Yong-huan1(1College of Horticulture,Henan Agricultural University,Zhengzhou,Henan 450002 China;2Zhengzhou Fruit Research Institute,CAAS,Zhengzhou,Henan 450009 China)

【机构】 河南农业大学园艺学院中国农业科学院郑州果树研究所

【摘要】 【目的】开发苹果EST-SSR引物,评价苹果种质资源的多样性与亲缘关系。【方法】利用NCBI数据库中苹果EST的SSR位点开发了35对EST-SSR引物,建立了苹果EST-SSR体系,并利用筛选出的16对引物对苹果品种资源的亲缘关系进行研究。【结果】118份基因组DNA共扩增出等位基因位点138个,位点数的变化从3到13不等,平均每对引物检测到8.62个位点,总的多态性比率为94.2%,各引物的多态性比例分布为81.8%~100%,相似系数为0.48~1.00。利用UPGMA法构建聚类树状图,在相似性系数0.65处可将118个供试材料分为5大组:其中第1组又可分为2个亚组,包含了绝大部分供试材料;第2、3、4和5组包含的品种数目分别为12个、11个、3个和2个;第5组与其他组亲缘关系较远,相似性系数仅为0.48。【结论】筛选出的16对EST-SSR引物可用于评价苹果种质资源间的遗传多样性。

【基金】 河南省教育厅科学技术研究重点项目(13A210484)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2013年04期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.2013.04.009
  • 【分类号】S661.1
  • 【被引频次】7
  • 【下载频次】329
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