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桃同株花色叶色嵌合体差异表达基因的cDNA-AFLP分析

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【作者】 李凡沈志军马瑞娟蔡志翔郭磊俞明亮

【Author】 LI Fan;SHEN Zhi-jun;MA Rui-juan;CAI Zhi-xiang;GUO Lei;YU Ming-liang;College of Horticulture, Nanjing Agricultural University;Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences;

【通讯作者】 Author for correspondence(

【机构】 南京农业大学园艺学院江苏省农业科学院园艺研究所

【摘要】 【目的】从转录水平初步探索桃同株花色叶色嵌合体颜色变异的分子机理。【方法】利用cDNA-AFLP技术,筛选桃嵌合体无性繁殖分离获得的不同颜色花瓣差异表达的基因;挑选差异片段进行克隆、测序和基因比对分析;利用qRT-PCR分析差异基因在不同基因型花和叶片中的转录表达。【结果】256对cDNA-AFLP引物共获得19个在粉色和白色花瓣之间具有差异的TDFs;克隆测序后成功获得其序列。Blastx比对和功能分类分析表明,17个TDFs与已知功能基因具有较高的相似值,8个涉及信号转导、5个涉及代谢过程、2个涉及细胞分化、1个涉及光合作用、1个涉及转录调控。选取12个在桃基因组中明确注释的TDFs进行qRT-PCR验证,结果发现5个基因(ppa005282m、ppa025850m、ppa001038m、ppa010768m、ppa023284m)在白花、绿叶基因型中表达量高,2个基因(ppa007494m和ppa015603m)在粉(或红)花、紫红叶片基因型中表达量高。【结论】桃嵌合体颜色变异可能涉及信号转导、代谢、转录调控等多种途径相关的生理、生化反应协同调控。

【关键词】 嵌合体差异表达cDNA-AFLP
【基金】 国家自然科学基金(31101517);农业部种质保护项目(NB2012-2130135-07);现代农业产业技术体系建设专项(CARS-31);江苏省农业科技自主创新(CX(12)5034)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2014年04期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20140033
  • 【分类号】S662.1
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】260
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