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香蕉枯萎病菌GATA转录因子基因Fnr1的克隆及序列分析

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【作者】 漆艳香张欣张贺陆英蒲金基喻群芳谢艺贤

【Author】 QI Yan-xiang;ZHANG Xin;ZHANG He;LU Ying;PU Jin-ji;YU Qun-fang;XIE Yi-xian;Environment and Plant Protection Institute, CATAS·Key Laboratory of Monitoring and Control of Tropical Agricultural and Forest Invasive Alien Pests, Ministry of Agriculture· Hainan Key Laboratory for Monitoring and Control of Tropical Agricultural Pests;

【机构】 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所·农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点开放实验室·海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室

【摘要】 【目的】明确香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)2个生理小种(Foc1和Foc4)GATA转录因子基因(Fnr1)的序列差异,为进一步研究Fnr1在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用奠定基础。【方法】根据番茄枯萎病菌2号生理小种(F.oxysporum f.sp.lycopersici race 2)和水稻恶苗病菌(Gibberella fujikuroi)的GATA转录因子的氨基酸序列设计引物,利用重叠延伸PCR和RT-PCR技术分别克隆了香蕉枯萎病菌2个生理小种的Fnr1的全长DAN,并对该基因所编码蛋白进行了氨基酸序列特征、系统发育与保守结构域分析。【结果】2个生理小种的Fnr1(分别命名为F1nr1和F4nr1)DNA片段全长分别为2 967 bp和2 958 bp,开放阅读框架分别为2 727 bp和2 718 bp,分别编码908个和905个氨基酸。F1nr1和F4nr1的预测氨基酸序列相似性为99%,与GenBank中公布的Fusarium spp.GATA转录因子氨基酸序列均有88%~99%相似性。氨基酸序列聚类分析显示,F1nr1和F4nr1与GenBank中已登陆的香蕉枯萎病菌1号生理小种(F.oxysporum f.sp.cubense race 1,Foc1)、尖孢镰刀菌(F.oxysporum)和番茄尖孢镰刀菌2号生理小种(F.oxysporum f.sp.lycopersici race 2)等物种的GATA转录因子蛋白高度同源。蛋白质保守域搜索表明,F1nr1和F4nr1具有GATA结合蛋白的功能域,属于GATA结合蛋白家族的一员。【结论】香蕉枯萎病菌Fnr1基因具备GATA构型转录因子家族的序列特征,推测该基因可能参与调控F.oxysporum f.sp.cubense氮调控相关基因的表达及致病性等。

【基金】 国际科技合作与交流专项(2012DFG31840);现代农业产业技术体系建设专项(CARS-32-04)
【所属期刊栏目】 植物保护·果品质量与安全 (2014年04期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20130492
  • 【分类号】S436.68
  • 【被引频次】7
  • 【下载频次】261
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