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杏遗传多样性评价所需SSR等位变异数目估计

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【作者】 章秋平刘威生刘硕魏潇刘宁

【Author】 ZHANG Qiuping;LIU Weisheng;LIU Shuo;WEI Xiao;LIU Ning;Liaoning Institute of Pomolgy;

【机构】 辽宁省果树科学研究所

【摘要】 【目的】研究等位变异数目的多少对杏材料间遗传关系分析结果的影响。【方法】以55对SSR引物对140份杏材料的检测结果为样本,运用矩阵相关检测的方法分析由不同SSR等位变异数目组成的相似矩阵与总等位变异相似系数矩阵之间的相关关系。【结果】所用SSR引物共检测到877个等位变异。随着抽取等位变异数目的增加,获得的相似矩阵与原矩阵(877等位变异)间的相关系数迅速增加。当选取的等位变异数目达到575时,与原等位变异共表型的相关性超过90%。【结论】所需最小等位变异数目与样本群体大小之间存在Y=149.5ln(X/12)+200.2的曲线方程,这个方程能够估算出在客观评价杏遗传群体时需要的最少SSR等位变异数目,并且认为这些SSR位点应尽量均匀分布在所有染色体上。

【基金】 国家自然科学基金项目(31401826和31071767);辽宁省农业领域青年科技创新人才培养计划(2014029)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2015年02期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20140392
  • 【分类号】S662.2
  • 【被引频次】5
  • 【下载频次】168
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