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2个中亚杏S-RNase基因全长的克隆与序列分析

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【作者】 李亚兰刘小芳刘海楠李文慧冯建荣

【Author】 LI Yalan;LIU Xiaofang;LIU Hainan;LI Wenhui;FENG Jianrong;Agricultural College of Shihezi University,Xinjiang Production and Construction Corps Key Laboratory of Special Fruits and Vegetables Cultivation Physiology and Germplasm Resources Utilization;

【机构】 石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室

【摘要】 【目的】克隆中亚杏(Prunus armeniaca)品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列,为分子手段调控杏自交不亲和性状奠定基础。【方法】以新疆栽培杏品种‘索格佳娜丽’和‘赛买提’为试材,利用RT-PCR克隆2个品种的花柱SRNase基因c DNA片段,RACE技术进行c DNA全长克隆,采用BLAST进行序列比对,Protparam软件分析2个基因的编码蛋白特性,MEGA 5.0构建进化树。【结果】从‘索格佳娜丽’中克隆了S52-RNase(KF951503)基因,从‘赛买提’中克隆了一个新的S53-RNase(KF975455)基因DNA和c DNA全长序列。S52-RNase的DNA全长2 200 bp,c DNA全长765 bp,ORF(开放阅读框)长681 bp,编码226个氨基酸;S53-RNase的DNA全长1 664 bp,c DNA全长907 bp,ORF长732 bp,编码242个氨基酸。BLASTP比对显示:这2个基因都具有保守的RNase-T2基因结构,属于RNase-T2家族。预测相对分子质量分别为26.5 ku和27.5 ku,等电点为9.36和9.03,都属于亲水性蛋白。进化分析表明,S52与李(Prunus salicina,S7)、S53与大岛樱(Prunus speciosa,S13)亲缘关系最近,S52和S53处在2个不同的分支上,表现出较高的序列多态性,表明2个基因亲缘关系较远。【结论】获得了2个中亚杏品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列。

【关键词】 自交不亲和S-RNase基因RACE
【基金】 国家自然科学基金面上项目(31272129)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2015年06期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20150133
  • 【分类号】S662.2
  • 【被引频次】6
  • 【下载频次】228
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