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香蕉不同器官中microRNA差异表达分析

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【作者】 王静毅武耀廷刘菊华贾彩红苗红霞张建斌王卓金志强徐碧玉

【Author】 WANG Jingyi;WU Yaoting;LIU Juhua;JIA Caihong;MIAO Hongxia;ZHANG Jianbin;WANG Zhuo;JIN Zhiqiang;XU Biyu;Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Ministry of Agriculture·Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences (CATAS);Qiongzhou University;Haikou Experimental Station·Hainan Provincial Key Laboratory for Genetics and Breeding of Banana, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences (CATAS);

【机构】 中国热带农业科学院热带生物技术研究所·农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室琼州大学中国热带农业科学院海口实验站·海南省香蕉遗传改良重点实验室

【摘要】 【目的】研究mi RNA在香蕉不同器官中的表达,初步探索mi RNA在香蕉生长发育过程中的可能作用。【方法】利用茎环引物的半定量和实时荧光定量PCR策略,检测香蕉中的保守mi RNA,并进一步研究mi RNA在香蕉根系、叶片、雄花和果实组织中的表达差异。【结果】mi RNA156d和mi RNA162a具有相似的表达模式,其最高表达量均出现在雄花组织中。mi R156d在雄花中的表达量(2.25)明显高于根系(0.17)、果实(0.34)和叶片(1.00);mi R162a在雄花中的表达量最高,为4.36,根系组织次之,为1.72,而在叶(1.00)和果实(0.99)中的表达几乎相同。mi R164e在根系中的表达量最高,为2.37,雄花次之,为1.93,而在叶(1.00)和果实(0.98)中表达几乎相同。mi R169h在4种组织中的表达量差异不明显。【结论】以香蕉各组织总RNA为模板,通过以SYBR Green为染料的Stem-loop q RT-PCR方法,成功地在香蕉根系、叶片、雄花和果实4种器官中均检测到了保守mi RNA的表达,表明本研究所建立的体系是定性或定量检测香蕉植株中保守mi RNA的准确而有效的方法。同时,在香蕉的不同组织中发现了具有显著表达差异的mi RNA,符合mi RNA在不同组织的表达活性具有多样性的规律。

【关键词】 香蕉MicroRNA实时荧光定量PCR表达
【基金】 国家自然科学基金(31501043,31401843);“十二五农村领域国家科技计划”(2011AA10020605);海南省自然科学基金(20153116);国家现代农业产业技术体系项目“国家香蕉产业技术体系”(CARS-32)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2016年07期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20150509
  • 【分类号】S668.1
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】219
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