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2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析

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【作者】 关鹏曾斌李疆罗淑萍王建友李伟阳田嘉李鹏

【Author】 GUAN Peng;ZENG Bin;LI Jiang;LUO Shuping;WANG Jianyou;LI Weiyang;TIAN Jia;LI Peng;College of Agronomy, Xinjiang Agricultural University;College of Forestry and Horticulture·Research Center for Xinjiang Characteristic Fruit Tree, Xinjiang Agricultural University;Xinjiang Branch of China Academy of Forestry Sciences;

【机构】 新疆农业大学农学院新疆农业大学林学与园艺学院·新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心中国林业科学院新疆分院

【摘要】 【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、Tmpred、Signal P、Target P、SOPMA、DANMAN、MEGA6和Prot Fun对推导的氨基酸序列进行分析。【结果】克隆到Pt S16-RNase基因和Pt S17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83%~98%,序列均具有S-RNas蛋白典型结构。Pt S16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,Pt S17-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸。预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素。【结论】获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列。

【基金】 国家自然科学基金(31260465);国家林业公益性行业科研专项(201304701-1,201304701-5);新疆维吾尔自治区科技计划项目(201130102-1-5);新疆维吾尔自治区果树学重点学科(201007)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2016年08期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20150520
  • 【分类号】S662.9
  • 【被引频次】3
  • 【下载频次】226
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