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火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析

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【作者】 彭磊吴艳刘小翠杨鵾范付华文晓鹏

【Author】 PENG Lei;WU Yan;LIU Xiaocui;YANG Kun;FAN Fuhua;WEN Xiaopeng;Institute of Agro-bioengineering and College of Life Sciences,Guizhou University·The Key Laboratory of Plant Resource Conservation and Germplasm Innovation in Mountainous Region (Ministry of Education);Anshun Academy of Agricultural Sciences,Guizhou Province;College of Forestry,Guizhou University;

【机构】 贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院·山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州省安顺市农业科学院贵州大学林学院

【摘要】 【目的】克隆Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(RT)序列并分析其特性,为火龙果遗传变异和进化研究提供新的信息。【方法】根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,从红肉和白肉火龙果及其突变体中扩增出430 bp左右的目标片段,回收、克隆、测序获得RT序列,并进行生物信息学分析;采用RT-PCR检测其转录活性。【结果】共获得82条RT序列,其中有55条序列发生终止密码子突变,5条序列发生移码突变;经RT序列对比,火龙果与水稻、拟南芥有较高的同源性;3条RT序列具有转录活性。【结论】火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列具有高度异质性,部分序列具有转录活性,与其他物种存在反转录转座子的横向传递。

【基金】 国家自然科学基金(31560549,31260464)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2017年02期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20160286
  • 【分类号】S667.9
  • 【被引频次】3
  • 【下载频次】284
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