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刺葡萄ISSR分子标记体系的建立及种质资源聚类分析

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【作者】 王美军黄乐刘昆玉杨国顺钟晓红徐丰白描金燕石雪晖

【Author】 WANG Meijun;HUANG Le;LIU Kunyu;YANG Guoshun;ZHONG Xiaohong;XU Feng;BAI Miao;JIN Yan;SHI Xuehui;Horticulture and Landscape College, Hunan Agricultural University·Hunan Engineering Technology Research Center for Grapes;

【机构】 湖南农业大学园艺园林学院·湖南省葡萄工程技术研究中心

【摘要】 【目的】建立刺葡萄(Vitis davidii Fo?x.)的ISSR分子标记体系以及分析刺葡萄种质资源的亲缘关系,为刺葡萄的保护和利用提供依据。【方法】以8份外缘葡萄品种或类型为对照,52份刺葡萄类型为材料,采用改良CTAB法提取植物基因组DNA,以基因组DNA为模板,用同一试验考察多个因素及水平的筛选方式对ISSR-PCR扩增反应体系中的Mg2+、d NTPs、引物、模板DNA的浓度及循环数进行优化,建立适用于刺葡萄的最佳ISSR-PCR反应体系;在优化的反应体系中进行多态性引物的筛选并进行分析,同时根据Jaccard遗传相似系数进行UPGMA聚类分析。【结果】采取改良CTAB法提取的刺葡萄DNA质量优于常规的CTAB法,在优化的ISSR-PCR反应体系中,从100条ISSR引物筛选出了13个具有多态性的引物,共检测到139个位点,其中多态性位点116个,多态位点百分率为83.45%。聚类结果显示,对照组8份外缘资源均在刺葡萄种群外,刺葡萄与华东葡萄的遗传距离较腺枝葡萄近;52份刺葡萄类型分为三大组群,两大江西刺葡萄组群及湖南与福建刺葡萄组群,而在湖南与福建刺葡萄种群中又分为4个群组。【结论】刺葡萄种质资源具有丰富的遗传多样性,ISSR分子标记可有效揭示刺葡萄种质资源的遗传多样性和亲缘关系,对刺葡萄种质资源的保护和利用有重要的意义。

【基金】 国家农业产业技术体系专项(CARS-30);湖南省葡萄工程技术研究中心(2012TP4012);湖南省科技厅农业重点项目(2009Ck-2010);湖南省高校科技成果产业化培育项目(09CY008);湖南省教育厅科学研究项目(15C0669)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2017年03期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20160018
  • 【分类号】S663.1
  • 【被引频次】11
  • 【下载频次】383
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