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基于p23基因的野生柑橘和栽培柑橘上衰退病毒分离株间的遗传特征分析

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【作者】 易龙周常勇

【Author】 YI Long;ZHOU Changyong;College of Life and Environmental Sciences, Gannan Normal University;Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences/Southwest University;

【机构】 赣南师范大学生命与环境科学学院中国农业科学院/西南大学柑桔研究所

【摘要】 【目的】比较分析野生柑橘与栽培柑橘上衰退病毒(CTV)分离株间的分子遗传特征,为深入解析CTV的遗传进化提供相关依据。【方法】运用RT-PCR对我国云南、广西、四川、湖南、江西等省(区)的11个野生柑橘上的CTV分离株和4个国内栽培甜橙及柚上的CTV强弱毒代表株分离株的p23基因进行扩增、测序,所获序列与Gen Bank收录的具有代表性的国外CTV分离株的相应基因序列进行比对分析。【结果】野生柑橘与国内外栽培柑橘上CTV分离株的p23基因序列相似率为87.7%~99.3%;密码子中碱基含量GC%<AT%,密码子转换数多于颠换数,第3位的碱基替换数最多,其次为第1位,最少是第2位;非同义突变与同义突变的比值(dN/dS)小于1,表明p23基因在进化过程中承受着净化选择。系统聚类分析表明,来自于野生柑橘上的11个CTV分离株在构建的系统发育树中分属不同的簇支,与不同来源地具有较高相似性和较低遗传距离的栽培柑橘上的CTV分离株构成同一组群。【结论】野生柑橘与栽培柑橘上的CTV分离株在碱基含量、密码子转换和颠换率及非同义突变与同义突变比值(dN/dS)等遗传特征方面均表现出一致性,系统发育分析表明,野生柑橘上CTV分离株基于p23基因序列的聚类关系与其地理来源之间无明显相关性。

【基金】 国家自然科学基金(30900977);江西省自然科学基金(20142BAB204010);江西省高等学校科技落地项目(KJLD13079);江西省重点研发项目(20161BBF60070)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2017年07期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20170035
  • 【分类号】S436.66
  • 【下载频次】69
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