节点文献

纸皮核桃内果皮硬化期差异表达基因筛选及功能预测

免费订阅

【作者】 鱼尚奇贾昌路宋岩刘春花郭永翠张文涛陈立平张锐

【Author】 YU Shangqi;JIA Changlu;SONG Yan;LIU Chunhua;GUO Yongcui;ZHANG Wentao;CHEN Liping;ZHANG Rui;Xinjiang Production and Construction Corps Key Laboratory of Protection and Utilization of Biological Resources in Tarim Basin;College of Life Science, Tarim University;Xinjiang University Institute of Science and Technology (Akesu Campus);College of Plant Science and Technology, Tarim University;The National and Local Joint Engineering Laboratory of High Efficiency and Superior-Quality Cultivation and Fruit Deep Processing Technology of Characteristic Fruit Trees in South;College of Information Engineering, Tarim University;

【通讯作者】 张锐;

【机构】 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室塔里木大学生命科学学院新疆大学科学技术学院(阿克苏校区)塔里木大学植物科学学院南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室塔里木大学信息工程学院

【摘要】 【目的】综合分析纸皮核桃内果皮硬化期转录本表达情况,获得3个代表样本间差异表达基因,为系统研究纸皮核桃内果皮木质化的分子机理打下基础。【方法】采用转录组测序技术对其内果皮硬化期3个样品测序,利用生物信息学方法和软件筛选样本间的差异表达基因并进行生物学功能预测。【结果】通过Trinity软件拼接得到76 814条Unigene,筛选出了609个差异表达基因,利用Gene Ontology和KEGG数据库对差异表达基因注释,发现差异表达基因显著富集在植物激素信号转导、苯丙烷类生物合成、苯丙氨酸代谢、ABC转运子合成、泛醌和其他萜类醌生物合成等途径中。【结论】筛出了纸皮核桃内果皮硬化期差异表达基因显著富集的主要代谢途径,为今后系统研究纸皮核桃内果皮木质化的分子机理打下了良好基础。

【基金】 兵团南疆重点产业创新发展支撑计划(2017DB006);国家自然科学基金(31260469);研究生科研创新项目(TDGRI201716)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2019年04期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20180436
  • 【分类号】S664.1
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】382
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

浏览历史:
下载历史: