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香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析

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【作者】 黎维丽余乃通李俊成王健华李宾宾刘志昕

【Author】 LI Weili;YU Naitong;LI Juncheng;WANG Jianhua;LI Binbin;LIU Zhixin;Institute of Tropical Agriculture and Forestry, Hainan University;Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, CATAS/Hainan Provincial Key Laboratory of Microbiology/Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Ministry of Agriculture and Rural Affairs;Institute of Fruit Tree Research, Guangdong Academy of Agricultural Sciences/Guangdong Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fruit Tree Research;

【通讯作者】 余乃通;刘志昕;

【机构】 海南大学热带农林学院中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室广东省农业科学院果树研究所·广东省热带亚热带果树研究重点实验室

【摘要】 【目的】探明杆状DNA病毒属病毒的ORFⅠ基因功能。【方法】本研究从香蕉条斑病毒云南分离株(BSV-YN)中克隆了BSV ORFⅠ基因,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN的分类地位;对其编码蛋白及同源物的理化性质、氨基酸序列组成、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、同源结构域、蛋白二级和三级结构等进行预测和分析。【结果】BSV ORFⅠ基因片段大小为528 bp,编码175个氨基酸,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN属于BSGFV种。生物信息学分析表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白都是不稳定的、亲水性蛋白,以丝氨酸和苏氨酸磷酸化为主。这些蛋白二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,无信号肽或跨膜区域。亚细胞定位预测表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白主要在细胞核分布,推测它们在病毒感染的宿主细胞核中发挥重要作用。【结论】推测BSV-YN ORFⅠ在病毒感染的宿主细胞核中参与病毒复制、转录等相关过程。本研究为进一步开展该蛋白的功能研究提供科学线索。

【基金】 广东省热带亚热带果树研究重点实验室开放基金(2017B030314113);中国热带作物学会青年人才托举工程(CSTCQN201704);中国热带农业科学院基本科研业务费专项(No.19CXTD-33)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2019年05期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20180490
  • 【分类号】S436.68
  • 【下载频次】205
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