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甜樱桃品种中新多态性SSR的鉴定、指纹图谱构建及聚类分析

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【作者】 王晶张开春张晓明闫国华周宇段续伟陈玲

【Author】 WANG Jing;ZHANG Kaichun;ZHANG Xiaoming;YAN Guohua;ZHOU Yu;DUAN Xu-wei;CHEN Ling;Beijing Academy of Forestry and Pomology Sciences;Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops(North China), Ministry of Agriculture and Rural Affairs;Beijing Engineering Research Center for Deciduous Fruit Trees;

【通讯作者】 张开春;

【机构】 北京市林业果树科学研究院农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室北京市落叶果树工程技术研究中心

【摘要】 【目的】应对迅速增加的甜樱桃品种及其分子鉴定需求,储备一批新多态性SSR,并获得其在甜樱桃品种中的基因型数据。【方法】从甜樱桃基因组测序开发的SSR库中,根据重复单元和重复次数在8条染色体上一共选择了96个SSR。用ABI3730,鉴定出其中9个SSR在4个代表甜樱桃品种中具有多态性。另外从305个李属SSR中又鉴定出9个多态性SSR。用S基因和多态性SSR排除了52个品种122个单株中S基因型不正确和混杂的品种或单株,然后用多态性信息比价高的11个SSR(其中包括8个新SSR)和S基因标记,构建了48个甜樱桃品种的指纹图谱库,并获得了可以区分48个品种的最少标记组合。【结果】聚类分析表明,48个甜樱桃品种组成了短低温组、中国组、北美组和东欧组。聚类分析结果可以和品种间亲缘关系及地域来源互相验证。【结论】鉴定了3个从未报道的甜樱桃品种的S基因型,验证了一种可以有效获得多态性SSR的途径,提供了9个新的多态性SSR及其等位基因大小,用12个分子标记构建了48个甜樱桃品种指纹图谱。本文提供的新SSR及其构建的甜樱桃品种指纹图谱真实可靠。

【关键词】 甜樱桃SSR指纹图谱S基因型
【基金】 北京市农林科学院协同创新专项(KJCX201910);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20161504、KJCX20170111);国家自然科学基金(31601726)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2019年12期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20190134
  • 【分类号】S662.5
  • 【下载频次】135
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