节点文献

葡萄APX基因家族的鉴定与表达分析

免费订阅

【作者】 王晗刘涛何红红梁国平马宗桓毛娟陈佰鸿

【Author】 WANG Han;LIU Tao;HE Honghong;LIANG Guoping;MA Zonghuan;MAO Juan;CHEN Baihong;College of Horticulture,Gansu Agricultural University;

【通讯作者】 毛娟;

【机构】 甘肃农业大学园艺学院

【摘要】 【目的】当植物遭受土壤盐碱、干旱和低温等非生物逆境胁迫时,其体内产生大量活性氧(Reactive Oxygen Species, ROS),影响植物正常生长发育甚至死亡。抗坏血酸过氧化物酶(Ascorbate Peroxidase, APX)能够有效清除逆境胁迫下产生的ROS,从而保护植物免受损害。本研究旨在葡萄全基因组中鉴定出APX基因家族成员,并探究其在非生物胁迫下的表达情况,为后续葡萄抗逆基因的挖掘和功能研究提供理论依据。【方法】以生长30 d的葡萄‘黑比诺’试管苗为材料,通过生物信息学方法分析该基因家族的理化性质、系统进化、启动子顺式作用元件分布、基因芯片表达情况,利用qRT-PCR分析该基因家族成员在不同逆境胁迫下表达情况。【结果】葡萄APX基因家族具有7个成员,其氨基酸数目分布在104~421,等电点(Isoelectric Point, pI)介于5.75~8.77。系统进化分析发现,葡萄VvAPX与水稻OsAPX同源性较高,拟南芥AtAPX次之。蛋白质二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主。亚细胞定位预测发现,VvAPX基因在叶绿体、线粒体和细胞质中表达较高。VvAPXs基因均含有A活性位点、H结合位点以及motif1保守基序。顺式作用元件分析结果发现,VvAPXs基因家族所有成员中均含有干旱胁迫应答元件(MYB)和抗旱元件识别位点(MYC)。基因芯片表达图谱显示,在高盐、PEG、低温处理条件下,与CK3相比7个基因均上调表达,其中VvAPX04较明显。qRT-PCR结果表明,VvAPX04在200 mmol·L-1NaCl处理下与对照相比显著性上调,是对照的14.5倍,在10%PEG处理下的表达量是对照的1.5倍。VvAPX05在10%PEG处理下与对照相比显著性上调,是对照的1.5倍。【结论】初步鉴定并提供了葡萄APX基因家族成员信息,预测了所具有的部分功能,为进一步研究葡萄APX基因参与非生物逆境胁迫的机制提供参考。

【关键词】 葡萄APX基因家族逆境胁迫表达分析
【基金】 甘肃省陇原创新团队项目(LQ20180918-1);甘肃省葡萄酒产业发展专项资金(039-041006);甘肃省科技重大专项(18ZD2NA006)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2020年04期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20190339
  • 【分类号】S663.1
  • 【下载频次】311
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

浏览历史:
下载历史: