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基于转录组测序分析NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根糖酵解相关基因的表达

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【作者】 何晨晨刘俐君鲁晓燕

【Author】 HE Chenchen;LIU Lijun;LU Xiaoyan;College of Agriculure/Xinjiang Production and Construction Corps Key Laboratory of Special Fruit Sand Vegetables Cultivation Physiology and Germplasm Resources Utilization, Shihezi University;

【通讯作者】 鲁晓燕;

【机构】 石河子大学农学院·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室

【摘要】 【目的】筛选新疆野苹果响应NaCl胁迫相关基因。【方法】以新疆野苹果组培苗为试验材料,对150 mmol·L-处理48 h后的新疆野苹果幼苗叶片及根系进行转录组测序。【结果】与对照相比,NaCl处理48 h时,新疆野苹果幼苗叶片中差异表达基因为3 364个,其中1 745个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,1 619个DEGs下调表达;根系中差异表达基因为3 808个,其中1 057个DEGs在盐胁迫响应中上调表达,2 751个DEGs下调表达。新疆野苹果叶片和根系中所共有的差异基因有2 095个得到注释,这些基因共涉及44个Pathway,富集最显著的Pathway主要有糖酵解/糖异生、磷酸戊糖途径、果糖和甘露糖代谢、丙酮酸代谢等。【结论】通过转录组测序和qRT-PCR验证发现,新疆野苹果受到NaCl胁迫后,在糖酵解过程中TPI、FBPase、pckA、PPDK等基因表达量发生明显变化,说明糖酵解途径在新疆野苹果应答NaCl胁迫过程中起着一定的作用。

【关键词】 新疆野苹果NaCl胁迫转录组测序糖酵解
【基金】 国家自然科学基金委NSFC-新疆联合基金(培育)项目(U1703116)
【所属期刊栏目】 种质资源·遗传育种·分子生物学 (2020年07期)
  • 【DOI】10.13925/j.cnki.gsxb.20200037
  • 【分类号】S661.1
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