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流感病毒M2质子通道抑制机理的计算化学模拟和理论分析

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【作者】 秦艳谢能中杜奇石黄日波

【Author】 QIN Yan;XIE Neng-zhong;DU Qi-shi;HUANG Ri-bo;State Key Laboratory of Non-food Biomass and Enzyme Technology,National Engineering Research Center for Non-food Biorefinery,Guangxi Academy of Sciences;Gordon Life Science Institute;

【机构】 广西科学院,非粮生物质酶解国家重点实验室,国家非粮生物质能源工程技术研究中心美国戈登生命科学研究所

【摘要】 【背景】A型流感病毒的M2质子通道蛋白的X-ray和NMR结构已于2008年测定,并成为发展抗流感的重要药物靶标,但学术界对于抑制剂的作用机理尚有争论。【方法】用SYBYL软件作M2通道蛋白与金刚烷胺抑制剂的对接计算,在可能的对接位点(Asp-44,Trp-41,His-37)上用精确的量子化学方法计算对接能,并根据结构化学和物理化学的原理分析抑制剂的作用机理。【结果】计算了金刚烷胺与M2质子通道的多个可能的结合位点的结合能,包括His-37,Trp-41和Asp-44。【结论】金刚烷胺对M2的抑制是一个动态过程,可能有多个位点结合。金刚烷胺穿透细胞膜后在通道出口与Asp-44形成盐桥,质子流使盐桥解离,金刚烷胺再进入通道与芳香氨基酸Trp-41(或His-37)形成阳离子-键。

【关键词】 流感病毒金刚烷M2质子通道抑制机理
【基金】 国家自然科学基金项目(31370716和31360207)资助
【所属期刊栏目】 计算科学 (2014年04期)
  • 【DOI】10.13657/j.cnki.gxkxyxb.20141126.007
  • 【分类号】O641.121;R373.13
  • 【下载频次】80
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