节点文献

头颈鳞癌靶向放射治疗敏感性lncRNA的初步筛选

免费订阅

【作者】 叶惠平易烛光龚正鹏

【Author】 YE Huiping;YI zhuguang;GONG zhengpeng;Department of Otorhinolaryngology,the Affiliated Baiyun Hospital of Guizhou Medical University;Department of Otorhinolaryngology,the Affiliated Hospital of Guizhou Medical University;Department of Otorhinolaryngology,Guizhou Provincial People’s Hospital;

【机构】 贵州医科大学附属白云医院耳鼻咽喉科贵州医科大学附院耳鼻咽喉科贵州省人民医院耳鼻咽喉科

【摘要】 目的:初步探讨长链非编码RNA(lnc RNA)在研究头颈鳞癌(HNSCC)放疗中的作用。方法:将HNSCC-SCCⅦ细胞分为对照组(不予放疗)和实验组(予放疗干预),应用芯片技术,筛选出放疗干预后HNSCCSCCⅦ细胞中差异表达的lnc RNA及m RNA,通过Cis和Trans法对靶基因进行预测,应用DAVID软件进行KEGG通路筛选,得到对应的靶基因富集的KEGG通路包括肿瘤相关通路、Wnt信号通路及轴突导向通路,分析这3条通路上对应的靶基因,并找到与这些靶基因对应的lnc RNA。结果:筛选出1 280条放疗差异表达的lnc RNA,对照组相对实验组高表达5倍以上的共15条,低表达5倍以上的共8条;筛选发现表达差异的m RNA有1 087条,对照组相对实验组高表达的528条,对照组相对实验组低表达559条;KEGG通路信息分析lnc RNA对应的靶基因富集于肿瘤相关通路、Wnt信号通路和轴突导向通路;Wnt信号通路中靶基因PRKCA和STAT5B对应的lnc RNA与m RNA是共表达的,对应的16203-3lnc RNA在对照组的表达为实验组的3.176倍(P<0.05),对应的31238-3lnc RNA在实验组中的表达量为对照组中的2.037倍(P<0.05)。结论:PRKCA和STAT5B可能是控制HNSCC放疗反应敏感性的靶基因,对应的16203-3lnc RNA和31238-3lnc RNA可作为调控HNSCC放疗敏感性的候选lnc RNA。

【关键词】 RNA,肿瘤芯片头颈部肿瘤KEGG通路放疗
【基金】 贵州省科学技术基金[黔科合LG(2012-068)号]
【所属期刊栏目】 临床研究 (2016年02期)
  • 【DOI】10.19367/j.cnki.1000-2707.2016.02.023
  • 【分类号】R739.91
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】152
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

浏览历史:
下载历史: