文献知网节
  • 记笔记
摘要:为了了解2018—2019年广东省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的遗传变异情况,试验采用RT-PCR方法对采集到的69份样品进行PEDV抗原检测,并对部分阳性样品的S1、M和ORF3基因进行测序,再利用分子生物学软件对测序结果与NCBI中的参考毒株进行遗传进化树的构建、同源性分析及氨基酸序列比对。结果表明:经RT-PCR检测有38份样品为PEDV阳性,阳性率为55%,阳性率较高。在PEDV S1基因遗传进化分析中,检测毒株均位于G2分支,与VN-VAP1113核苷酸序列同源性较高,为96.0%~97.6%;主要有3个氨基酸缺失、5个氨基酸插入及多个氨基酸突变。在PEDV M基因遗传进化分析中,GDxh毒株位于G1-2分支,与DR13核苷酸序列同源性较高,为98.3%;GDhz-1毒株位于G2-1分支,与VN-VAP1113核苷酸序列同源性较高,为98.3%;其他12株毒株位于G2-2分支,与OH851核苷酸序列同源性较高,为97.4%~99.1%;主要有5个氨基酸突变和1个氨基酸插入。在PEDV ORF3基因遗传进化分析中,GDxh毒株与DR13核苷酸序列同源性为91.6%,主要有4个氨基酸突变和一段氨基酸缺失;其他检测毒株均位于G2分支,其中7株毒株与OH851核苷酸序列同源性为90.2%~92.0%,主要有5个氨基酸突变;另外5株毒株与VN-VAP1113核苷酸序列同源性均为87.6%,主要有11个氨基酸突变。说明2018—2019年广东省PEDV流行毒株主要为G1型和G2型,流行情况复杂,其S1和ORF3基因对应的氨基酸序列容易发生突变、插入或缺失,给该地区猪流行性腹泻的防治工作带来较大挑战。
  • DOI:

    10.13881/j.cnki.hljxmsy.2019.12.0395

  • 专辑:

    农业; 理工A(数学物理力学天地生)

  • 专题:

    生物学; 畜牧与动物医学

  • 分类号:

    S852.65

  • 手机阅读
    即刻使用手机阅读
    第一步

    扫描二维码下载

    "移动知网-全球学术快报"客户端

    第二步

    打开“全球学术快报”

    点击首页左上角的扫描图标

    第三步

    扫描二维码

    手机同步阅读本篇文献

  • HTML阅读
  • CAJ下载
  • PDF下载

下载手机APP用APP扫此码同步阅读该篇文章

下载:14 页码:18-25 页数:8 大小:1829K

相关文献推荐
  • 相似文献
  • 读者推荐
  • 相关基金文献
  • 关联作者