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五氯酚暴露诱导斑马鱼胚胎细胞凋亡相关基因的变化及caspase-2基因克隆和系统进化分析

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【作者】 朱含开吴兆毅赵庆顺尹大强

【Author】 ZHU Han-kai1,WU Zhao-yi1,ZHAO Qing-shun2,YIN Da-qiang1,3 1. State Key Laboratory of Pollution Control and Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, Nanjing 210093 2. Model Animal Research Center, Nanjing University, Nanjing 210061 3. MOE Key Laboratory of Yangtze River Water Environment, Tongji University, Shanghai 200092

【机构】 南京大学环境学院污染控制与资源化国家重点实验室南京大学模式动物研究所

【摘要】 应用基因芯片技术研究发现,暴露于五氯酚的斑马鱼胚胎中有14个涉及细胞凋亡行为的基因表达发生了显著改变.利用生物信息学方法构建这些功能基因系统进化树,分析与环境毒物诱导的细胞凋亡行为密切相关的caspase-2基因和其他基因之间的同源关系.斑马鱼caspase-2基因由10个外显子和9个内含子组成,cDNA长1308bp,含一个开放阅读框(ORF),编码435个氨基酸.6种脊椎动物Caspase-2氨基酸序列的保守性及系统进化分析结果表明,在特定功能区结构域中氨基酸序列表现出较高的同源性,Caspase-2在进化上高度保守.利用RT-PCR技术,斑马鱼caspase-2基因cDNA被克隆并确认.研究结果表明斑马鱼caspase-2基因是一个研究细胞凋亡行为的模型分子,可为环境化合物的分子毒性评价及其机制研究提供一种分子标记。

【关键词】 caspase-2基因斑马鱼细胞凋亡进化树五氯酚
【基金】 国家自然科学基金项目(No.20577022)
【所属期刊栏目】 专论 (2008年04期)
  • 【分类号】Q355
  • 【被引频次】14
  • 【下载频次】466
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