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底泥水体中适用于PCR的不同形态DNA的提取方法

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【作者】 冯凌罗义

【Author】 FENG Ling,LUO Yi Key Laboratory of Pollution Processes and Environmental Criteria,Ministry of Education,College of Environmental Sciences and Engineering,Nankai University,Tianjin 300071

【机构】 南开大学环境科学与工程学院环境污染过程与基准教育部重点实验室

【摘要】 提出直接从环境河流底泥和表层水体中同时提取不同形态DNA(胞内、胞外、染色体和质粒DNA)的有效方法.利用该方法提取了海河典型区域底泥的胞外DNA和胞内DNA及水体中细菌染色体DNA和质粒DNA.结果表明,NaH2PO4提取的胞外DNA分子量大于1kb,提取率40%~72%,没有共提取胞内DNA.胞内DNA提取的分子量均大于23.1kb,细菌质粒DNA与染色体DNA同时分离.16SrDNA与sul2扩增验证提取方法可靠性.16SrDNA扩增结果显示所有胞外DNA呈阴性,胞内DNA呈阳性.质粒DNA和染色体DNA的16SrDNA扩增显示,染色体DNA结果显阳性,质粒DNA呈阴性,sul2的结果相反.

【关键词】 胞外DNA胞内DNA染色体DNA质粒DNA提取方法
【基金】 国家自然科学基金(No.2077704;No.30870363);天津市自然科学基金(No.08JCYBJC02700)
【所属期刊栏目】 方法与技术 (2010年02期)
  • 【分类号】X171.5
  • 【被引频次】6
  • 【下载频次】398
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