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亚硝态氮胁迫下菲律宾蛤仔实时定量PCR内参基因的筛选

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【作者】 王爱云曹滕飞吕家森丛明

【Author】 Wang Aiyun;Cao Tengfei;Lv Jiasen;Cong Ming;School of Life Sciences,Ludong University;College of Life Science,Yantai University;Yantai Institute of Coastal Zone Research,Chinese Academy of Sciences;

【通讯作者】 王爱云;吕家森;

【机构】 鲁东大学生命科学学院烟台大学生命学院中国科学院烟台海岸带研究所

【摘要】 为了更好地从基因角度研究亚硝态氮对贝类的生态毒性,需要筛选一个合适的内参基因作为参考,对其毒性相关基因进行定量表达分析。本研究以菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)作为研究对象,以亚硝态氮胁迫的鳃组织cDNA作为模板,利用geNorm软件和NormFinder软件对6个候选内参基因进行表达稳定性分析,并对2个结果做了综合赋权分析。结果显示,geNorm分析的基因表达稳定性结果为Actin>CyPA>EF1α>Ubi>18S>Tubu,NormFinder软件分析的结果为Actin>Ubi>CyPA>EF1α>18S>Tubu,最后经加权赋值法综合分析获得6个候选基因的表达稳定性为Actin>CyPA>Ubi>EF1α>18S>Tubu,即Actin为表达最稳定的基因。因此,Actin可以作为衡量亚硝态氮胁迫后菲律宾蛤仔鳃组织中基因表达的内参基因。

【基金】 国家自然基金面上项目(41876135);鲁东大学高端人才团队建设费(108-10000318)
【所属期刊栏目】 专论 (2019年01期)
  • 【分类号】Q78;X171.5
  • 【下载频次】47
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