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一种新的核酸自动化提取方法在病原体检测中应用的评价

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【作者】 朱丽媛叶文佳鲁福娜唐皎雪夏小凯牛培华谭文杰

【Author】 ZHU Li-yuan;YE Wen-jia;LU Fu-na;TANG Jiao-xue;XIA Xiao-kai;NIU Pei-hua;TAN Wen-jie;Shanghai GeneoXD Biotech Company Limited;

【通讯作者】 牛培华;谭文杰;

【机构】 上海捷诺生物科技有限公司中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

【摘要】 目的评价一种新的核酸自动化提取方法在病原体检测中的应用。方法分别用试剂盒(QIAamp Viral RNA Mini Kit)和核酸自动提取仪Genolution NX-48平行提取同一批104份临床咽拭子样本,利用商业化的RespiFinder SMART22多重荧光PCR检测试剂盒和甲型流感病毒实时荧光定量PCR检测试剂盒,比较两种核酸提取方法对不同病原体检出率及甲型流感病毒最低检测限的影响。结果临床咽拭子样本经两种方法提取核酸后用于呼吸道多病原检测,结果具有高度一致性(Kappa> 0. 60)。可检出19种呼吸道病原,包括DNA病毒、RNA病毒及非病毒病原,其中检出率较高的病原为鼻病毒/肠道病毒(rhinovirus/enterovirus,Rhino/Entero)、肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae)、甲型流感(influenza A,InfA)病毒及腺病毒(adenovirus,Adeno)。QIAamp Viral RNA Mini Kit及核酸自动提取仪Genolution NX-48提取的甲型流感病毒的最低检测限为1. 36×10~0和1. 41×10~1 PFU/m L,差异无统计学意义(P> 0. 05)。结论核酸自动提取仪Genolution NX-48应用性能良好,提取核酸省时、快捷、成本低,结合RespiFinder SMART22多重荧光PCR检测试剂盒,可进行临床和实验室大量样本的核酸快速提取及呼吸道多病原检测。

【基金】 国家重点研发计划(2016YFD0500300,2016YFC1200900)
【所属期刊栏目】 诊断制剂 (2019年05期)
  • 【DOI】10.13200/j.cnki.cjb.002613
  • 【分类号】R446.5
  • 【下载频次】194
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