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柯萨奇病毒A组16型抗原表位预测

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【作者】 白晗马淑花郭会杰刘少华李秀玲

【Author】 BAI Han;MA Shu-hua;GUO Hui-jie;LIU Shao-hua;LI Xiu-ling;National Vaccine & Serum Institute;

【通讯作者】 李秀玲;

【机构】 国药中生生物技术研究院有限公司

【摘要】 目的应用模拟表位策略研究柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)抗原表位。方法分别以具有中和活性的抗CA16单克隆抗体2C6、4F9、1D8为靶分子,在噬菌体12肽库中淘选可与之特异性结合的阳性克隆,对淘选得到的阳性克隆进行序列测定和比对,并采用Phage ELISA法进行特异性鉴定。同时利用生物信息学方法对CA16衣壳蛋白理化性质进行分析,并与阳性噬菌体多肽序列和结构进行比对,预测CA16中和抗原表位。结果经噬菌体12肽库筛选,单克隆抗体2C6、4F9、1D8淘选阳性噬菌体富集率分别为2.39×10~3、1.32×10~4和3.762×10,获得可与单克隆抗体2C6、4F9、1D8结合的阳性克隆分别为10、11、6种,其中各组共有基序分别为K+X+WW和N/Q+S/T+Y/F/W、K+X+WW+D/E、T+X+P+W。Phage ELISA特异性鉴定阳性克隆肽CA1和CB1、FB3和FC3、DA1和DA2、DA5分别强特异性结合单克隆抗体2C6、4F9、1D8。经计算机预测分析,确定了主要位于CA16 VP1 800-810区域,并涉及VP4、VP3上的多个中和表位区域。结论应用模拟表位策略成功筛选出了CA16中和抗原表位,为CA16蛋白抗原结构、新型表位疫苗及诊断试剂的进一步研究奠定了基础。

【基金】 国家十三五重大新药创制(其他)(2016zx09101120)
【所属期刊栏目】 基础研究 (2019年10期)
  • 【DOI】10.13200/j.cnki.cjb.002825
  • 【分类号】R373.22
  • 【下载频次】67
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