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安徽省部分地区2016–2018年猪圆环病毒2型遗传进化分析

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【作者】 俞赵荣张达白彩霞王小朋杨侃侃孙裴李传峰彭开松李永东王勇

【Author】 YU Zhao-Rong;ZHANG Da;BAI Cai-Xia;WANG Xiao-Peng;YANG Kan-Kan;SUN Pei;LI Chuan-Feng;PENG Kai-Song;LI Yong-Dong;WANG Yong;College of Animal Science and Technology, Anhui Agricultural University;Shanghai Veterinary Research Institute,CAAS;Ningbo Municipal Center for Disease Control and Prevention;

【通讯作者】 李永东;王勇;

【机构】 安徽农业大学动物科技学院中国农业科学院上海兽医研究所宁波市疾病预防控制中心

【摘要】 【背景】猪圆环病毒(Porcinecircovirus,PCV)可以引起断奶仔猪多系统衰竭综合症(Postweaningmultisystemicwastingsyndrome,PMWS)。【目的】了解安徽省部分地区猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况。【方法】采用PCR技术,对2016-2018年间安徽省部分地区猪场疑似PMWS感染的组织样品共计31份进行PCV2检测和全基因扩增,并通过DNAStar等生物信息学软件对所得到的PCV2毒株基因序列进行遗传进化分析。【结果】所得的8株PCV2安徽株与GenBank上已发表的国内外参考毒株相比较,核苷酸相似性为92.8%-99.0%,ORF2及其推导的氨基酸序列相似性分别为85.8%-99.6%和82.5%-100%。遗传进化树分析结果显示8株安徽株中有1株PCV2a,2株PCV2b,5株PCV2d,未发现PCV2c、PCV2e和PCV2f基因型。此外,通过对ORF2基因编码的氨基酸序列分析,发现各基因型Cap蛋白氨基酸序列上的位点具有其独特性。【结论】近年来PCV2在安徽地区的猪群中感染较为普遍,其中PCV2d基因型的感染病例增多,逐渐成为安徽地区的优势流行株。本研究为安徽地区的PCV2防控提供了一定的参考依据。

【基金】 国家自然科学基金(31602063);安徽省自然科学基金(1508085QC60)~~
【所属期刊栏目】 动物病毒学专栏 (2019年07期)
  • 【DOI】10.13344/j.microbiol.china.180883
  • 【分类号】S852.651
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