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烟草种子内生细菌群落结构与多样性

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【作者】 谢红炼汪汉成蔡刘体周浩刘畅陆宁史彩华王香萍

【Author】 Honglian Xie;Hancheng Wang;Liuti Cai;Hao Zhou;Chang Liu;Ning Lu;Caihua Shi;Xiangping Wang;College of Agriculture, Yangtze University;Guizhou Academy of Tobacco Science;College of Life Sciences, Yangtze University;

【通讯作者】 汪汉成;史彩华;王香萍;

【机构】 长江大学农学院贵州省烟草科学研究院长江大学生命科学学院

【摘要】 【目的】为了解烟草种子内生细菌的群落结构和多样性。【方法】分别对3个品种(K326、云烟85、云烟87)烟草种子内生细菌的16S rRNA基因V3–V4区进行扩增,采用Illumina MiSeq测序技术对扩增片段进行高通量测序,并对3个品种烟草种子内生细菌群落结构和多样性进行分析。【结果】3个品种种子共获得的V3–V4区高质量序列片段128558条,Shannon指数计算为2.03–3.73,K326和云烟85内生菌多样性指数高于云烟87。3品种烟草种子内生细菌的优势门均为变形菌门Proteobacteria、放线菌门Actinobacteria、厚壁菌门Firmicute和拟杆菌门Bacteroidete。3个品种烟草种子内生细菌共有菌属共有27个,K326和云烟85的最优势菌属为假单胞菌属(Pseudomonas),云烟87的最优势菌属为大肠杆菌志贺菌属(Escherichia-shigella)。16S功能预测显示各种子中产生了丰度较高的蛋白质、核苷酸、糖类、辅酶及代谢产物合成的有益功能信息。【结论】烟草种子内生细菌多样性丰富,不同品种种子细菌群落组成基本相似,其丰度存在一定差异性。种子中存在的潜在有益细菌包括假单胞菌、类芽孢杆菌、根瘤菌、马赛菌、藤黄单胞菌、萨勒河菌、Lelliottia菌等,具有大量代谢相关的有益功能。研究结果为今后烟草种子内生菌的功能研究和利用以及种子病害生物防控提供参考信息。

【基金】 中国博士后科学基金(2017M610585);贵州省科技厅优秀青年人才培养计划(黔科合平台人才[2017]5619);中国烟草总公司贵州省公司科技项目(201711,201714,201914);国家自然科学基金(31960550)~~
【所属期刊栏目】 研究报告 (2020年03期)
  • 【DOI】10.13343/j.cnki.wsxb.20190275
  • 【分类号】S572
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】204
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