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基于生物信息学分析SOX12在口腔鳞状细胞癌中的表达及验证

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【作者】 王珍珍杜文治贾如刘洁逯宜

【Author】 WANG Zhen-zhen;DU Wen-zhi;JIA Ru;LIU Jie;LU Yi;Key Laboratory of Shaanxi Province for Craniofacial Precision Medicine Research;College of Stomatology, Xi’an Jiaotong University;

【通讯作者】 逯宜;

【机构】 西安交通大学口腔医学院陕西省颅颌面精准医学研究重点实验室

【摘要】 目的通过生物信息学分析转录因子SOX12在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达,进一步探讨其与OSCC临床病理特征的关系,阐明SOX12对OSCC早期诊断及预后的影响。方法运用GEPIA数据库结合TCGA数据库分析SOX12在OSCC组织中的表达水平,并通过qRT-PCR进行体外验证;利用LinkedOmics数据库描述SOX12表达与OSCC临床病理学参数的相关性及对预后的影响;从String-DB数据库中分析SOX12在信号转导中的位置及与其关系密切的上下游基因。结果 SOX12在OSCC中呈高表达,且与OSCC病理分级、T分期、N分期呈正相关;TCGA分析显示,SOX12的表达与OSCC患者术后总体生存率有关;与SOX12相互作用的蛋白有POU3F1、POU3F2、POU3F3、MYT1L、NRSN2等,主要参与神经元的分化和发育等功能。结论 SOX12在OSCC中呈高表达,并与OSCC多个病理性指标相关。

【关键词】 口腔鳞癌SOX12数据库分析
【基金】 西安交通大学基本科研项目(No.xzy012019088)~~
【所属期刊栏目】 基础研究 (2020年01期)
  • 【分类号】R739.8
  • 【下载频次】81
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