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以PIK3CA突变及突变相关的基因构建子宫内膜样腺癌的预后预测模型

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【作者】 张舜刘彩艳谭桂春张雯雯曲芃芃

【Author】 Zhang Shun;Liu Caiyan;Tan Guichun;Tianjin Medical University;Tianjin Central Hospital of Gynecology Obstetrics;

【通讯作者】 张雯雯;曲芃芃;

【机构】 天津医科大学天津市中心妇产科医院

【摘要】 目的:研究PIK3CA突变与子宫内膜样腺癌预后的关系,尝试建立相关的预后模型。方法:从TCGA数据库获取子宫内膜样腺癌患者相关信息,将患者分为PIK3CA突变组和野生组,比较两组患者的总生存(OS)和无进展生存(PFS)。筛选突变相关的差异表达基因(DEGs),再用Kaplan-Meier(KM)生存分析和LASSO回归分析筛出预后相关的DEGs。将患者随机分为训练集和验证集。在训练集中建立COX回归模型,将患者分为高危组和低危组,对其进行生存分析、绘制时间受试者工作特征(ROC)曲线并计算曲线下面积(AUC),再在验证集验证。对模型进行单因素和多因素COX回归分析,将模型和临床病理因素作为参数构建临床预测模型,计算一致性指数并绘出列线图。结果:PIK3CA突变显著影响了子宫内膜样腺癌患者的OS和PFS;6个与预后相关的DEGs(HMP19、GRIA1、MESP2、CARTPT、CD177、SCGB2A2)被筛出;在训练集和验证集中高危组患者的OS都更差(P<0.05),1年、3年、5年ROC曲线的AUC均大于0.69。单因素和多因素cox回归分析显示模型是独立预后因子。在训练集和验证集中,利用模型和其他信息预测患者5年生存率的一致性指数分别为0.83和0.74。结论:发生PIK3CA突变的子宫内膜样腺癌患者的预后更好,以PIK3CA突变及相关基因建立的预后预测模型在临床应用上有着潜在价值。

【关键词】 子宫内膜样腺癌预后PIK3CA突变基因TCGA数据库模型
【基金】 国家自然科学基金青年基金(No:81802605);天津市科技计划项目(No:19YFZCSY00600)
【所属期刊栏目】 论著 (2020年05期)
  • 【DOI】10.13283/j.cnki.xdfckjz.2020.05.002
  • 【分类号】R737.33
  • 【下载频次】119
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