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广西防城港市HIV-1流行株env基因C2V3区序列特征及亚型分析

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【作者】 劳飞翔莫实德邓培雪黄洁洁梁林盼黎玲莉廖玮梁冰玉叶力

【Author】 LAO Feixiang;MO Shide;DENG Peixue;HUANG Jiejie;LIANG Linpan;LI Lingli;LIAO Wei;LIANG Bingyu;YE Li;Guangxi Key Laboratory of AIDS Prevention and Control & Public Health of Guangxi Medical University;

【通讯作者】 叶力;

【机构】 广西医科大学公共卫生学院广西艾滋病防治研究重点实验室防城港市疾病预防控制中心广西医科大学生命科学研究院

【摘要】 目的了解近期防城港市HIV-1流行毒株env基因C2V3区亚型及分布特征,为防城港市防治艾滋病工作提供科学依据。方法于2017年10月~2018年4月在防城港市人民医院收集199例定点随访的接受抗病毒治疗的HIV感染者或艾滋病病人(human immunodeficiency virus/acquired immunodeficiency syndrome,HIV/AIDS)的流行病学调查信息和10 ml外周血。从外周血白细胞中提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应对获得的HIV-1前病毒DNA env C2V3区基因片段进行扩增,并进行DNA测序,获得的DNA序列信息使用Sequencher 5.1、MEGA 5.0软件进行清理和分析。结果本研究共收集199例HIV/AIDS,其人口学特征主要以年龄18~49岁为主,占53.70%;职业以农民和待业为主,分别占42.59%、45.37%;学历以初中及以下为主,占89.81%;民族以汉族为主,占75.93%;传播途径以异性传播为主,占93.52%。成功扩增HIV-1env C2V3区基因108例,其中CRF01AE(Circulating Recombinant Forms,CRF)亚型103例,CRF BC亚型3例,B、CRF5901B亚型各1例。发现8种gp120 V3环顶端四肽,其中以GPGQ为主,占50.00%;其次为GPGR和GPGK,分别占22.22%、12.96%。预测辅助受体为CXCR4(chemo-kine receptor 4) 59例,占54.63%;其次是CCR5辅助受体(chemo-kine receptor 5)30例,占27.78%;CXCR4/CCR5辅助受体19例,占17.59%。结论防城港市主要流行HIV-1 CRF01AE亚型,其流行毒株亚型存在多态性。防城港市HIV-1型CRF01AE毒株膜区V3环氨基酸顶端四肽存在较高的多态性,使用CXCR4辅助受体的HIV-1毒株比例高于用CCR5辅助受体的毒株。

【基金】 广西自然科学基金(2018GXNSFAA138070);广西艾滋病防治研究重点实验室开放课题(gxlapt201403);广西医科大学未来学术之星—大学生课外创新科研课题(WLXSZX18085)
【所属期刊栏目】 论著 (2019年07期)
  • 【分类号】R512.91
  • 【下载频次】33
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