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乌拉尔甘草HMGR基因cDNA的克隆与序列分析

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【作者】 荣齐仙许巧仙刘春生黄璐琦

【Author】 RONG Qixian1,XU Qiaoxian1,LIU Chunsheng1,HUANG Luqi2 (1.School of Chinese Materia Medica,Beijing University of Traditional Chinese Medicine,Beijing 100102,China;2.Institute of Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China)

【机构】 北京中医药大学中药学院中国中医科学院中药研究所

【摘要】 目的:对乌拉尔甘草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3methylglutary CoA reductase,HMGR)的cDNA克隆并进行序列分析。方法:根据NCBI数据库中的豆科其他物种HMGR的cDNA保守区设计引物,利用同源扩增和cDNA末端快速扩增技术从甘草根中获得目的基因;利用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找开发阅读框,Prosite分析蛋白质的基本结构域,Clustal x比对已有HMGR的氨基酸序列,并构建进化树。结果:得到1个全长为1 842 bp的HMGR的cDNA序列,含有1 722 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码573个氨基酸,具有HMGR家族的特异序列,推测的氨基酸序列与豌豆、蒺藜苜蓿的氨基酸序列一致性分别为84%,76%。结论:对甘草HMGR基因的cDNA进行了克隆,为进一步研究3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A在甘草酸生物合成途径中的作用提供了理论依据。

【关键词】 甘草HMGRRACE
【基金】 国家自然科学基金项目(30672615)
【所属期刊栏目】 资源与鉴定 (2011年10期)
  • 【分类号】S567.71
  • 【被引频次】9
  • 【下载频次】346
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