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一个新的丹参3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶3基因的克隆及其表达分析

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【作者】 张夏楠郭娟申业黄璐琦

【Author】 ZHANG Xia′nan,GUO Juan,SHEN Ye,HUANG Luqi(Institute of Chinese Materia Medica,Chinese Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China)

【机构】 中国中医科学院中药研究所

【摘要】 目的:对丹参3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3methylglutary CoA reductase,HMGR3)基因的cDNA克隆并进行序列分析。方法:利用丹参转录组文库克隆一种新的丹参次生代谢途径上的功能基因;利用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找开放阅读框,Clustal W比对丹参中已有的3条HMGR的氨基酸序列,构建系统进化树,QRT-PCR检测丹参HMGR3基因在根、茎、叶中的mRNA水平,并检测Ag+诱导子诱导后丹参毛状根中该基因的转录水平。结果:克隆得到一个新的丹参HMGR3基因,该基因ORF全长1 692 bp,编码563个氨基酸,具有HMGR基因家族的特征序列,与SmHMGR1和SmH-MGR2分别具有75.04%,80.64%的同源性,QRT-PCR分析表明该基因在丹参根茎叶中均有表达,在叶中表达量最高,Ag+诱导24 h时mRNA水平达到最高值。结论:首次克隆得到了1条新的丹参HMGR家族基因SmHMGR3,这一结果为进一步研究丹参次生代谢途径提供了新的思路和靶点。

【基金】 国家自然科学基金项目(81072990,30901965)
【所属期刊栏目】 资源与鉴定 (2012年16期)
  • 【分类号】S567.53;R282
  • 【被引频次】17
  • 【下载频次】316
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