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丹参SmNAC1基因的克隆和生物信息学分析

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【作者】 王亚君蒋超赵容赵乐申业黄璐琦

【Author】 WANG Ya-jun1,JIANG Chao1,ZHAO Rong1,ZHAO Le2,SHEN Ye1,HUANG Lu-qi1(1.National Resource Center for Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China; 2.College of Pharmaey,Henan University of Traditional Chinese medicine,Zhengzhou 450008,China)

【机构】 中国中医科学院中药资源中心河南中医学院药学院

【摘要】 为了研究丹参中特有的NAC转录子在丹参生长发育、激素调节和抗逆胁迫应答调节中的功能,对丹参NAC转录因子进行了克隆和分析。根据丹参毛状根cDNA文库中筛选到的NAC EST序列,克隆了丹参SmNAC1的cDNA全长序列。生物信息学分析显示基因的开放阅读框591 bp,编码166个氨基酸,相对分子质量21.66 kDa,等电点4.36 Genbank kF006346。SmNAC1蛋白的N-端具有保守的NAC_AB结构域,C-端高度变异。根据软件预测SmNAC1可能定位在细胞核。qRT-PCR分析YE+Ag+处理后SmNAC1在丹参毛状根中的表达变化,处理后2 h表达量上调至对照的1.5倍,4~12 h保持2倍的表达量,36 h时下降至对照水平以下,推测SmNAC1可能参与了丹参毛状根对YE+Ag+的胁迫应答调节。

【关键词】 丹参NAC转录因子SmBF3-2分子克隆生物信息学
【基金】 国家自然科学基金项目(81173490,81130070)
【所属期刊栏目】 资源与鉴定 (2013年13期)
  • 【分类号】S567.53;R282.7
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】349
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