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基于实时荧光定量PCR对镉处理下黄花蒿内参基因稳定性的分析

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【作者】 周良云莫歌王升唐金富岳红黄璐琦邵爱娟郭兰萍

【Author】 ZHOU Liang-yun;MO Ge;WANG Sheng;TANG Jin-fu;YUE Hong;HUANG Lu-qi;SHAO Ai-juan;GUO Lan-ping;National Resource Center for Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences;Changchun Medical College;Institute of Chinese Materia Madica,China Academy of Chinese Medical Sciences;

【机构】 中国中医科学院中药资源中心长春医学高等专科学校中国中医科学院中药研究所

【摘要】 研究选取黄花蒿的Actin,18S rRNA,PAL,GAPDH,CPR作为候选内参基因,设计特异性引物,通过实时荧光定量PCR,利用geNorm,NormFinder,BestKeeper,Delta CT以及RefFinder软件和方法对5种内参基因在不同浓度镉处理下黄花蒿叶片中的表达稳定性进行分析,为黄花蒿基因差异表达研究提供可靠的内参基因,确保黄花蒿基因表达分析结果的可靠性。结果表明在不同浓度镉处理下,黄花蒿叶片中候选内参基因的表达稳定性存在差异,综合分析得出候选内参基因表达稳定性顺序依次为Actin>18S rRNA>PAL>GAPDH>CPR。因此,在黄花蒿基因差异表达分析中,可以考虑选取Actin,18S rRNA,PAL作为内参基因,采用多内参校正结果。此外,研究还发现同浓度镉处理下黄花蒿叶片中的候选内参基因表达稳定性也存有差异,这说明即使在同一处理条件下也有必要进行内参基因的筛选。总之,该研究首次提供了在不同浓度镉处理下黄花蒿叶片中比较理想的内参基因,也为其他条件下黄花蒿的基因表达分析提供了参考。

【基金】 国家自然科学基金项目(81130070,81072989);国家中医药管理局行业科研专项(201107009)
【所属期刊栏目】 资源与鉴定 (2014年05期)
  • 【分类号】R284
  • 【被引频次】19
  • 【下载频次】573
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