基于trnL-trnF序列的人参和西洋参DNA条形码鉴定研究

【作者】 宋晓娜； 顾选； 刘春生； 李妍芃； 张雪； 张媛； 刘勇； 马长华；

【Author】 SONG Xiao-na;GU Xuan;LIU Chun-sheng;LI Yan-peng;ZHANG Xue;ZHANG Yuan;LIU Yong;MA Chang-hua;School of Chinese Materia Medica,Beijing University of Chinese Medicine;

【机构】 北京中医药大学中药学院；

【摘要】 探讨trnL-trnF序列的相似度、特异位点、遗传距离和系统发育树这4个分子鉴定指标对人参和西洋参药材的鉴定能力,优化人参和西洋参分子鉴定指标。从人参和西洋参药材中提取DNA,以trnL-trnF通用引物进行扩增测序,利用NCBI数据库中的BLAST功能计算相似度,利用DNAman软件比较特异位点,利用Mega软件计算遗传距离,构建系统发育树。结果表明,人参和西洋参的种内相似度均为100%,种间相似度为99.6%;人参和西洋参分别在G153A,T463A,C732G,T818C有特异位点;种内遗传距离(0)小于种间遗传距离(0.004);系统发育树中人参和西洋参均分为2个单系分支。因此,利用trnL-trnF序列,相似度、特异位点、遗传距离和系统发育树指标均可以区分人参和西洋参。综合分析,trnL-trnF序列的G153A,T463A,C732G,T818C特异位点指标是人参和西洋参的最佳鉴定指标。更多还原